斑點叉尾鮰體型較長，體前部寬于后部，頭較小，吻稍尖，口亞端位，體表光滑無鱗，粘液豐富，側線完全，皮膚上有明顯的側線孔。頭部上下頜具有深灰色觸須4對，其中鼻須1對，頜須1對，頤須2對，長短各異，以頜須為長，末端超過胸鰭基部，鼻須短。鰓孔較大，鰓膜不連于峽部，頤部有較明顯而不規(guī)則的斑點，體重大于0.5公斤的個體斑點消失。具有脂鰭一個，尾鰭分叉較深，各鰭均為深灰色。體兩側背部淡灰色，腹部乳白色，幼魚體兩側有明顯而不規(guī)則的斑點，成魚斑點逐步不明顯或消失。