無塵無菌車間是車間既能達到無塵效果，又能達到無菌效果的一種新有名詞。它是污染控制的源頭。在工廠里，沒有無塵室，污染敏感度高的零件不可能批量生產(chǎn)。無塵無菌車間被定義為具備空氣過濾、優(yōu)化、構(gòu)造材料和組裝的房間，其中特定的規(guī)定操作程序是控制空氣懸浮微粒濃度，從而達到其規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)。

無菌車間又叫無菌室，它的要求更高，除了按潔凈室要求處理空氣中微粒外，還需要對室內(nèi)空氣進行處理，即同時要去除生物污染源，對室檢查還需要對室內(nèi)空氣采樣培養(yǎng)，以杜絕感染源。醫(yī)院手術(shù)室、血液透析室、藥品及三類一次性醫(yī)療用品生產(chǎn)都要求使用無菌室；但是檢測時需要檢測浮游菌、沉降菌等菌落數(shù)。

無塵無菌車間內(nèi)空氣的流動有兩種情況：一種是層流的(即室內(nèi)一切懸浮粒子都保持在層流層中運動);另一種是非層流的(即室內(nèi)空氣的流動是紊流的)。裝有一般空調(diào)系統(tǒng)的潔凈室，室內(nèi)空氣的流動屬于非層流(紊流)，既可使空氣中夾帶的混懸粒子迅速混合，也可使室內(nèi)靜止的微粒重新飛揚，部分空氣還可出現(xiàn)停滯狀態(tài)。

一方面是徹底，另一方面防止污染，是無菌技術(shù)的兩個方面。另外，還要防止所研究的微生物，特別是致病微生物或經(jīng)過基因工程改造了的本來自然界不存在的微生物從實驗容器中逃逸到外界環(huán)境中去。為了這些目的，在微生物學(xué)中，有許多措施。