潔凈室按空氣清潔程度分類，如果無塵室的等級只用塵粒數目來敘述，則可假設塵粒的尺寸為0.5μm，例如，1級、10級、例如100級無塵室塵埃粒子數目分別小于或等于1顆、10顆、100顆。如果塵粒尺寸不是0.5μm，無塵室等級應以在一特定塵粒尺寸的級數來表示，分別分為1級、10級、100級、1000級、10000級、100000級，數值越小，凈化級別就越高。潔凈度越高造價就越高。

潔凈室是指將一定空間范圍內之空氣中的微粒子、有害空氣、等之污染物排除,并將室內之溫度、潔凈度、室內壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電控制在某一需求范圍內,而所給予特別設計之房間。亦即是不論外在之空氣條件如何變化,其室內均能俱有維持原先所設定要求之潔凈度、溫濕度及壓力等性能之特性。

萬級無菌室有足夠的存儲空間擺放物品以方便使用。在實驗室工作區(qū)域處還有供長期使用的存儲空間。在實驗室的工作區(qū)域處應有存放個人衣物的條件。在實驗室所有的建筑內配備高壓蒸汽自凈器，并按期檢查和驗證，以保證符合要求。

在實驗室內配備生物柜。設洗眼設施，必要時應有應急噴淋裝置。考慮機械通風，如使用窗戶自然通風，有防蟲紗窗。有可靠的電力供應和應急照明。必要時，重要設備如培養(yǎng)箱、生物柜、冰箱等應設備用電源。實驗室出口有在黑暗是可明確辨認的標識。