財務(wù)軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準(zhǔn)的財務(wù)軟件來替代手工記賬。

會計資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現(xiàn)遺失或毀損時無法查找。

代理記賬單位通常是定期或定時上門服務(wù)，日常業(yè)務(wù)可通過電話溝通，會計不是隨時在單位辦理和咨詢業(yè)務(wù)

個別 “代理記賬公司”沒有代理記賬資質(zhì)（市財政局批準(zhǔn)的代理記賬許可證、會計上崗證等），發(fā)生問題可以回避責(zé)任，損害委托單位的利益。這也是小企業(yè)在選擇代賬服務(wù)公司時必須要注意的事項。

代理記賬機(jī)構(gòu)可以接受委托，受托辦理委托人的下列業(yè)務(wù)：

1、根據(jù)委托人提供的原始憑證和其他資料，按照國家統(tǒng)一的會計制度的規(guī)定進(jìn)行會計核算，包括審核原始憑證、填制記賬憑證、登記會計賬簿、編制財務(wù)會計報告等；

2、對外提供財務(wù)會計報告；

3、向稅務(wù)機(jī)關(guān)提供稅務(wù)資料；

4、委托人委托的其他會計業(yè)務(wù)。

納稅人因住所、經(jīng)營地點變動，涉及改變稅務(wù)登記機(jī)關(guān)的，應(yīng)當(dāng)在向工商行政管理機(jī)關(guān)或者其他機(jī)關(guān)申請辦理變更或者注銷登記前或者住所、經(jīng)營地點變動前，應(yīng)向原稅務(wù)登記機(jī)關(guān)申報辦理注銷稅務(wù)登記，并在30日內(nèi)向遷達(dá)地稅務(wù)機(jī)關(guān)申報辦理稅務(wù)登記。