高新技術(shù)企業(yè)專項審計，是依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認定辦法相關(guān)規(guī)定，對近三年的研發(fā)費用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入情況進行審計，出具審計專項報告。該報告主要用于企業(yè)申辦高新技術(shù)企業(yè)或高新技術(shù)企業(yè)復審使用。提供給科委、財政、稅務(wù)、工商單位及管理層和董事會等相關(guān)。

高新技術(shù)企業(yè)專項審計工作從業(yè)務(wù)承接到完成通常要經(jīng)過以下步驟：

1、會計師事務(wù)所和高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位進行初步溝通了解，確定高新技術(shù)企業(yè)專項審計目的、審計范圍、審計收費等；并簽訂業(yè)務(wù)約定書；

2、會計師事務(wù)所安排項目組，下發(fā)委托方高新技術(shù)企業(yè)專項審計準備的資料清單；

3、被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位按照資料清單準備相關(guān)審計資料，并確定現(xiàn)場審計時間。

4、現(xiàn)場審計階段；

5、審計情況匯總和形成審計報告初稿；

6、與被審高新技術(shù)企業(yè)專項審計單位交換意見；

7 、出具正式審計報告。

要求針對研究開發(fā)項目和高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))了解申報企業(yè)及其環(huán)境，比如，了解申報企業(yè)產(chǎn)品(服務(wù))的技術(shù)變化，了解申報企業(yè)研究開發(fā)部門的設(shè)置和分布，以及是否存在專門的機構(gòu)和人員從事研究開發(fā)活動，了解申報企業(yè)為從事研究開發(fā)活動而進行的固定資產(chǎn)投入以及為這些投入而使用的資金的來源，了解申報企業(yè)是否確立了創(chuàng)建科技創(chuàng)新型企業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略，了解申報企業(yè)是否將高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入作為主要的業(yè)績考核指標。

高新審計依據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認定辦法相關(guān)規(guī)定，企業(yè)申請高新認定，需要對近三年的財務(wù)狀況、研發(fā)費用支出情況及高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入情況進行審計，出具審計專項報告和年度審計報告。

會計師會結(jié)合企業(yè)情況，給出一份準備材料的清單。主要是企業(yè)的資產(chǎn)負債表、損益表、總賬、明細賬、科目余額表(到末級科目)、財務(wù)憑證、公司的執(zhí)照、章程等等。