據(jù)醫(yī)院官網(wǎng)2015年12月信息顯示，醫(yī)院設(shè)置165個臨床、醫(yī)技科室，233個護(hù)理單元，擁有8個國家重點(diǎn)學(xué)科、1個國家重點(diǎn)實(shí)驗室、20個省部級及全軍重點(diǎn)實(shí)驗室、33個全軍醫(yī)學(xué)?？浦行暮脱芯克?，形成了以綜合診療為特色的13項專業(yè)優(yōu)勢。同時是全軍重癥監(jiān)護(hù)示范基地和中華護(hù)理學(xué)會的培訓(xùn)基地。設(shè)有國際醫(yī)學(xué)中心和健康醫(yī)學(xué)中心，提供高端預(yù)防保健服務(wù)。醫(yī)院年門急診量490余萬人，收容19.8萬人，手術(shù)近9萬例。

為節(jié)約患者在北京醫(yī)院掛號排隊等候的時間，特開通北京醫(yī)院代掛號服務(wù)，預(yù)約北京三甲醫(yī)院的專家和以下醫(yī)院掛號：北京301醫(yī)院代掛號，北京大學(xué)醫(yī)院代掛號，北京兒童醫(yī)院代掛號，北京協(xié)和醫(yī)院代掛號，北京同仁醫(yī)院代掛號，北京宣武醫(yī)院代掛號，北京腫瘤醫(yī)院代掛號，北大口腔醫(yī)院代掛號，北京婦產(chǎn)醫(yī)院代掛號

在中心主任陳香美院士的領(lǐng)導(dǎo)下，建立了臨床研究、項目支持、公共服務(wù)和交流推廣等平臺，建成具有國際規(guī)模的腎臟疾病臨床信息數(shù)據(jù)庫和生物樣本資源庫，聯(lián)合全國500余家單位構(gòu)建腎臟疾病臨床協(xié)同研究網(wǎng)絡(luò)，覆蓋全國90%的地級市。針對我國主要疾病負(fù)擔(dān)的IgA腎病、糖尿病腎病、老年腎臟病等常見慢性腎臟病以及急性腎損傷和尿毒癥患者血液凈化，從疾病危險因素、預(yù)警、診斷、和醫(yī)療質(zhì)量改進(jìn)多個層面，建立多中心、大樣本、長期穩(wěn)定隨訪的研究隊列，組織開展大規(guī)模、多中心、高質(zhì)量的臨床診療研究，已成為臨床新技術(shù)、藥品器械研發(fā)與評價的創(chuàng)新基地，帶動我國慢性腎病防治整體水平的提升。

2019年在科技部組織的首次績效評估中，國家慢性腎病臨床醫(yī)學(xué)研究中心成績?yōu)椤啊薄?/p>

2019年7月由科技部、國家衛(wèi)生健康委、軍委后勤保障部和原食品藥品監(jiān)管總局正式批準(zhǔn)依托解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心成立國家感染性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心。研究中心整合國內(nèi)79家協(xié)作醫(yī)院，針對慢性乙肝、慢性丙肝、艾滋病及其相關(guān)疾病等病種，建立病程涵蓋臨床各個階段的大隊列，同時建立標(biāo)準(zhǔn)化的生物樣本庫、臨床診療信息庫及的疾病發(fā)病追蹤系統(tǒng)，形成涵蓋重大感染性疾病及各個病程的資源平臺，終建立我國規(guī)范的病毒性肝炎、艾滋病臨床大數(shù)據(jù)及生物樣本庫整合平臺，形成專業(yè)的管理團(tuán)隊，為建立符合我國人群特點(diǎn)的肝病、艾滋病診療體系提供重要戰(zhàn)略性資源。