醫(yī)院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業(yè)技術人員。醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發(fā)明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。 [2]

2017年11月11日下午，復旦大學醫(yī)院管理研究所正式發(fā)布了《2016年度中國醫(yī)院排行榜》和《2016年度中國醫(yī)院專科聲譽排行榜》，中國人民解放軍總醫(yī)院名列第三。

中國人民解放軍總醫(yī)院前身是中國協(xié)和醫(yī)學院第二臨床學院，1953年10月，總后方勤務部衛(wèi)生部決定將“中國協(xié)和醫(yī)學院第二臨床學院”改為“軍委直屬機關醫(yī)院”。

1954年7月，總后方勤務部衛(wèi)生部將“軍委直屬機關醫(yī)院”改為“中國人民解放軍第三〇一醫(yī)院”。

1957年6月，國防部批示“中國人民解放軍第三〇一醫(yī)院”番號撤銷，改稱為“中國人民解放軍總醫(yī)院”。

軍醫(yī)進修學院是以解放軍總醫(yī)院為依托建設和發(fā)展起來的，始建于1958年11月，1962年停辦。

1979年6月，經(jīng)中央軍委批準恢復軍醫(yī)進修學院。

1986年9月批準正式列入全軍院校編制序號。

2004年全軍整編將三〇四醫(yī)院更名為三〇四臨床部，對外稱解放軍總醫(yī)院附屬醫(yī)院，列入解放軍總醫(yī)院編制序列。

2009年2月，解放軍總醫(yī)院與海南省正式簽訂共同建設海南分院戰(zhàn)略合作協(xié)議，拉開了總醫(yī)院歷史上跨地域、整建制異地辦院的序幕；

2009年8月，海南分院在三亞海棠灣破土動工；

2009年8月，解放軍總醫(yī)院第二附屬醫(yī)院（原309醫(yī)院）完成轉隸移交，隸屬總參謀部領導，更稱呼為解放軍總參謀部總醫(yī)院。

2011年12月，38.3萬平方米的現(xiàn)代醫(yī)療城竣工并投入試運行；

2012年6月9日，解放軍總醫(yī)院海南分院正式開診運行。

中心主任簡介：

王福生，男，中國科學院院士、主任醫(yī)師。國家感染性疾病臨床醫(yī)學研究中心主任，解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學中心感染病診療與研究中心主任，全軍傳染病研究所所長。國家杰出青年基金獲得者、國家973（肝病）項目首席科學家、國家自然科學基金創(chuàng)新研究群體牽頭人。

國家耳鼻咽喉疾病臨床醫(yī)學研究中心是為加強我國耳鼻咽喉疾病醫(yī)學科技創(chuàng)新體系建設、打造臨床醫(yī)學和轉化研究的“高地”而創(chuàng)建的項目，目標是形成我國耳鼻咽喉疾病重大臨床醫(yī)學研究的“國家隊”。

擬通過開展高質(zhì)量循證醫(yī)學研究、驗證新技術和新方法、實施多學科交叉轉化研究、開發(fā)和推廣基層適宜技術、探索臨床研究方法和管理模式，搭建國家耳鼻咽喉疾病臨床研究公共技術支撐的平臺。通過高質(zhì)量臨床多中心研究，出指南、出理論、出技術、出產(chǎn)品、出成效，為國家制定政策提供依據(jù)，以提高耳鼻咽喉疾病防控能力，改善民眾健康。