北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱(chēng)“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國(guó)際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過(guò)敏)科為原國(guó)家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)批準(zhǔn)的國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，中醫(yī)眼科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局批準(zhǔn)的中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在院內(nèi)。醫(yī)院設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設(shè)北京同仁眼庫(kù)(國(guó)際眼庫(kù)協(xié)會(huì)會(huì)員)。

青光眼科一直以來(lái)就是同仁眼科的重點(diǎn)專(zhuān)業(yè)。多年來(lái)，在國(guó)內(nèi)眼科學(xué)界長(zhǎng)期占據(jù)優(yōu)勢(shì)地位，并在國(guó)際上享有一定的影響力。目前，青光眼科是中華醫(yī)學(xué)會(huì)眼科學(xué)分會(huì)青光眼學(xué)組組長(zhǎng)單位，也是中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)眼科學(xué)分會(huì)青光眼委員會(huì)主任委員單位。

青光眼科主要的特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì)是注重臨床和科研相結(jié)合。在保持原有臨床技術(shù)優(yōu)勢(shì)的情況下，注重基礎(chǔ)科研工作，在國(guó)內(nèi)學(xué)術(shù)界具有優(yōu)勢(shì)。

青光眼科有博士研究生導(dǎo)師一人，碩士研究生導(dǎo)師兩人;有正高級(jí)職稱(chēng)人員5人，副高級(jí)職稱(chēng)人員人9人;青光眼科常年承擔(dān)首都醫(yī)科大學(xué)及首都醫(yī)科大學(xué)國(guó)際學(xué)院本科生、研究生、國(guó)際學(xué)生的臨床授課任務(wù);青光眼科每日的平均門(mén)診病人量200-300人次，科室開(kāi)放床數(shù)52張，年手術(shù)量超過(guò)3000臺(tái)，青光眼科住院部的床位使用率常年超過(guò)，術(shù)前平均住院日低于4天，各項(xiàng)醫(yī)療指標(biāo)位居全國(guó)前列。其中2/3的患者來(lái)自外地，每年培養(yǎng)研究生和進(jìn)修醫(yī)生近百名。

北京同仁醫(yī)院眼外傷專(zhuān)科成立于1968年，是國(guó)內(nèi)早成立的集臨床、科研、教學(xué)于一體的眼外傷專(zhuān)科。北京同仁眼外傷專(zhuān)科技術(shù)力量雄厚，學(xué)科梯隊(duì)合理，擁有包括多位經(jīng)驗(yàn)豐富、享有盛譽(yù)的專(zhuān)家和教授在內(nèi)的近20名副主任醫(yī)師以上職稱(chēng)的高級(jí)專(zhuān)業(yè)人才。每月專(zhuān)家門(mén)診量在1700人次以上，固定病床50余張，年手術(shù)量達(dá)5000人次以上。