CRCC實行總監(jiān)責任制，設有綜合業(yè)務部、機車事業(yè)部、基礎設施事業(yè)部、城市軌道設備事業(yè)部、投訴監(jiān)理部等5個專業(yè)部門和相應的后勤保障部門。

為了保證認證機構的公正性，2003年4月成立了鐵路產(chǎn)品認證管理委員會，2012年改為“鐵路產(chǎn)品認證公正性管理委員會”；2011年10月又成立了“城市軌道交通裝備認證工作委員會”。

CRCC開展的產(chǎn)品認證工作在國家認證認可監(jiān)督管理委員會的領導下，按專業(yè)領域分別受鐵路產(chǎn)品認證公正性管理委員會和城軌裝備認證工作委員會的公正性監(jiān)督管理，以及中國認證機構國家認可管理委員會（CNAS）的指導和監(jiān)督。

基礎部以鐵道部標準計量研究所為基礎，主要包括：鐵路行業(yè)標準化研究室、鐵路專用計量室、國家軌道衡計量站、國家鐵路罐車容積計量站。