北京大學腫瘤醫(yī)院有國家重點學科1個(腫瘤學)、國家臨床重點專科2個(腫瘤科、病理科)、北京市重點學科4個(胃癌防治中心、乳腺癌防治中心、影像介入中心、超聲診斷中心)、北京市中醫(yī)管理局重點學科1個(中西醫(yī)結合科暨老年腫瘤科)，全國名老中醫(yī)藥專家傳承工作室1個，北京學者工作室2個，是消化系腫瘤整合防治全國重點實驗室，是惡性腫瘤發(fā)病機制及轉化研究教育部重點實驗室、惡性腫瘤轉化研究北京市重點實驗室、國家藥監(jiān)局重點實驗室所在單位、抗腫瘤新藥及新技術研發(fā)北京市工程研究中心、北京市國際科技合作基地、北京市首批示范性研究型病房、科技部抗腫瘤新藥療效與性評價信息化平臺的建設單位。被國家衛(wèi)健委授予首批腫瘤多學科診療試點醫(yī)院、國家首批腫瘤高通量基因測序臨床試點單位;是承擔北京地區(qū)癌癥發(fā)病登記與生存統(tǒng)計，并向政府及WHO提供數據的中心。是北京協(xié)會、北京癌癥康復會的掛靠和依托單位。

研究所建所以來，在腫瘤學基礎理論研究、常見主要腫瘤的臨床診斷與、胃癌、食管癌高發(fā)區(qū)現(xiàn)場的預防干預研究等領域均有創(chuàng)新與的成績，在國內外頗具影響。

北京大學腫瘤醫(yī)院與許多國際知名腫瘤研究機構建立了密切的合作關系，每年不斷有國內外專家學者來院參觀、考察、講學，進行科研協(xié)作與學術交流。醫(yī)院也不斷有科研、臨床、醫(yī)技專業(yè)人員出國訪問、進修、短期工作或參加國際學術會議。

北京大學腫瘤醫(yī)院以建設患者的國際化腫瘤集團中心為自己的發(fā)展愿景，堅持內生式發(fā)展、外延式增長兩個發(fā)展方向，實施國內前列、國內、國際知名三個發(fā)展階段，采取過硬的品牌學科、的管理團隊、的專家隊伍、人性化的醫(yī)院文化思想四項發(fā)展措施，讓每一位腫瘤患者在就醫(yī)中獲益。