北大醫(yī)院前身為北京醫(yī)科專門學(xué)校附設(shè)診察所，后陸續(xù)更名為北京醫(yī)科大學(xué)校附屬醫(yī)院、北平大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院等。1946年，醫(yī)院隨北平大學(xué)醫(yī)學(xué)院并入北京大學(xué)，由此得名“北大醫(yī)院”。1952年，全國(guó)高等學(xué)校院系調(diào)整，北京大學(xué)醫(yī)學(xué)院獨(dú)立建院，設(shè)立北京醫(yī)學(xué)院，后又更名為北京醫(yī)科大學(xué)，醫(yī)院隨之先后更名為北京醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院、北京醫(yī)學(xué)院第 一醫(yī)院、北京醫(yī)科大學(xué)第 一醫(yī)院。2000年，北京大學(xué)與北京醫(yī)科大學(xué)再次合并，醫(yī)院隨之更名為“北京大學(xué)第 一醫(yī)院”。2008年，醫(yī)院成為中央保健基地醫(yī)院。

北大醫(yī)院學(xué)科齊全，綜合實(shí)力居于國(guó)內(nèi)前列、國(guó)際一 流，臨床醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科整體進(jìn)入國(guó)家雙建設(shè)學(xué)科范圍?，F(xiàn)有4個(gè)教育部重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），1個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），3個(gè)北京市重點(diǎn)學(xué)科（牽頭），7個(gè)教育部重點(diǎn)學(xué)科（參與）；獲批國(guó)家臨床重點(diǎn)?？平ㄔO(shè)項(xiàng)目29次，覆蓋25個(gè)學(xué)科。

2022年度中國(guó)醫(yī)院聲譽(yù)排行榜中，1個(gè)學(xué)科位列全國(guó)第 一，5個(gè)學(xué)科排名前五、9個(gè)學(xué)科排名前十。在領(lǐng)軍人才建設(shè)方面，擁有中國(guó)工程院院士1人、國(guó)家自然科學(xué)基金創(chuàng)新群體1人、萬(wàn)人計(jì)劃領(lǐng)軍人才/團(tuán)隊(duì)6人、國(guó)家自然科學(xué)基金杰出青年基金獲得者10人、長(zhǎng)江學(xué)者特聘/特崗教授5人、教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)2人、科技部領(lǐng)軍人才/團(tuán)隊(duì)6人，其他國(guó) 家級(jí)高層次人才13人、北京市高層次人才31人。

北京大學(xué)第 一醫(yī)院依托國(guó)家高水平醫(yī)院臨床研究和成果轉(zhuǎn)化能力試點(diǎn)項(xiàng)目，搭建生物樣本庫(kù)、研究型病房、交叉研究平臺(tái)、大數(shù)據(jù)AI平臺(tái)等，形成基礎(chǔ)研究、轉(zhuǎn)化研究、臨床研究為一體的創(chuàng)新平臺(tái)。在2022年度中國(guó)醫(yī)院醫(yī)院科技量值（STEM）排行榜中位列第14位，其中1個(gè)學(xué)科排名全國(guó)第 一，6個(gè)學(xué)科排名前十、9個(gè)學(xué)科排名前二十。近五年來(lái)，獲批國(guó)家、省部市、校級(jí)和橫向課題，以及臨床試驗(yàn)合計(jì)2300余項(xiàng)，經(jīng)費(fèi)約16億元，其中縱向課題超9億元。累計(jì)發(fā)表論文6000余篇，SCI（即《科學(xué)引文索引》）收錄論文3000余篇，其中部分發(fā)表在包括《Nature》、《New Engl J Med》、《JAMA》、《BMJ》等國(guó)際期刊上。獲國(guó)家、教育部、北京市、中華醫(yī)學(xué)會(huì)等科技成果獎(jiǎng)70項(xiàng)，其中國(guó)家及部委級(jí)獎(jiǎng)項(xiàng)12項(xiàng)。