北京兒童醫(yī)院技術(shù)力量雄厚。擁有重點(diǎn)學(xué)科兒科學(xué)，國家兒童腫瘤監(jiān)測中心、國家呼吸系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、國家中西醫(yī)協(xié)同旗艦醫(yī)院試點(diǎn)單位等12個(gè)平臺(tái)，8個(gè)國家臨床重點(diǎn)專科，5個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，2個(gè)北京市級研究平臺(tái)以及16個(gè)市級醫(yī)療中心。醫(yī)院設(shè)有疑難罕見病例會(huì)診中心和遠(yuǎn)程會(huì)診中心，兒科疑難重癥疾病的診斷水平居國內(nèi)地位，是中華醫(yī)學(xué)會(huì)兒科學(xué)分會(huì)、兒外科分會(huì)，中國醫(yī)師協(xié)會(huì)小兒外科醫(yī)師分會(huì)，中華護(hù)理學(xué)會(huì)兒科專業(yè)委員會(huì)主任委員單位。

北京兒童醫(yī)院共有在職職工3210人，其中醫(yī)生968人，護(hù)士1325人，醫(yī)技462人。正高級職稱292人，副高級職稱380人，中級職稱692人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科學(xué)奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學(xué)開創(chuàng)者胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻(xiàn)專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀(jì)百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學(xué)基金獲得者等眾多高層次人才。

北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學(xué)科龍 頭作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年?duì)款^組建北京兒童醫(yī)院集團(tuán)，創(chuàng)新“病人不動(dòng)、醫(yī)生移動(dòng)”的模式服務(wù)全國患兒，目前理事單位成員已達(dá)57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機(jī)構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認(rèn)定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

在國內(nèi)率先開展了兒童正常腦發(fā)育和神經(jīng)障礙性疾病的多模態(tài)磁共振研究,首次利用酰胺質(zhì)子轉(zhuǎn)移成像和磁化轉(zhuǎn)移成像技術(shù)發(fā)現(xiàn)兒童腦白質(zhì)的游離蛋白含量隨著腦發(fā)育進(jìn)程逐漸減低,提出APT成像技術(shù)可以用來監(jiān)測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認(rèn)知功能癱瘓概念(認(rèn)知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認(rèn)知的重大推進(jìn)。這是一個(gè)全新的精神病理學(xué)概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術(shù)建立0-2歲嬰幼兒腦白質(zhì)模板,以填充和彌補(bǔ)人類腦計(jì)劃中嬰幼兒腦發(fā)育的空白?