北京同仁醫(yī)院以醫(yī)院綜合醫(yī)療為主體，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所為附屬科研機(jī)構(gòu)，形成 “一院三所”發(fā)展格局，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國(guó)際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為國(guó)家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過(guò)敏)科為國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，中醫(yī)眼科學(xué)為中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。

北京同仁醫(yī)院擁有教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，工信部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室5個(gè);工程研究中心1個(gè)，省部級(jí)工程研究中心4個(gè);省部級(jí)國(guó)家科技合作基地2個(gè)，北京實(shí)驗(yàn)室1個(gè)。醫(yī)院是全國(guó)防盲技術(shù)指導(dǎo)組和防聾治聾技術(shù)指導(dǎo)組組長(zhǎng)單位，設(shè)有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，作為國(guó)際眼庫(kù)協(xié)會(huì)會(huì)員單位，設(shè)有北京同仁眼庫(kù)。

北京同仁醫(yī)院眼底科引領(lǐng)國(guó)內(nèi)眼底病治 療的發(fā)展方向，在國(guó)內(nèi)率先開(kāi)展了間接檢眼鏡下孔源性視網(wǎng)膜脫離的手術(shù)治 療，蕞早開(kāi)展了玻璃體視網(wǎng)膜顯微手術(shù)，創(chuàng)新了視網(wǎng)膜中央動(dòng)脈栓塞的玻璃體手術(shù)治 療，在驅(qū)逐性出血以及眼底腫瘤的放射性敷貼治 療和局部切除手術(shù)治 療等多個(gè)方面處于國(guó)內(nèi)和國(guó)際前沿。

北京同仁醫(yī)院眼底科是我國(guó)培養(yǎng)眼底病專(zhuān)科高級(jí)醫(yī)療技術(shù)人員的主要基地之一。已經(jīng)形成了一支年齡與知識(shí)結(jié)構(gòu)合理、學(xué)歷層次高、兼顧臨床和臨床相關(guān)基礎(chǔ)研究、技術(shù)力量雄厚的眼底病學(xué)術(shù)梯隊(duì)，形成了新老結(jié)合、穩(wěn)健而富有生氣的團(tuán)結(jié)協(xié)作的集體，同時(shí)也成為一支具有凝聚力和較強(qiáng)攻關(guān)能力的團(tuán)隊(duì)。本專(zhuān)科在職60人，目前擁有17名在職正高級(jí)職稱醫(yī)師和20名副高級(jí)職稱醫(yī)師，其中有6名為教授/博士生導(dǎo)師，7名為副教授/碩士生導(dǎo)師。擁有眼內(nèi)腫瘤診治研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；醫(yī)學(xué)人工智能研究與驗(yàn)證工信部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。