近年來，醫(yī)院對外合作取得實(shí)質(zhì)進(jìn)展，集團(tuán)化發(fā)展初具規(guī)模。2018年，受張家口市人民政府和崇禮區(qū)政府委托，接管崇禮區(qū)人民醫(yī)院，北醫(yī)三院崇禮院區(qū)揭牌；受北京大學(xué)指派，與延安市政府正式簽約，托管延安市中醫(yī)醫(yī)院，北醫(yī)三院延安分院揭牌；與首都機(jī)場集團(tuán)公司合作，接管北京首都國際機(jī)場醫(yī)院，北醫(yī)三院首都國際機(jī)場院區(qū)揭牌。此外，兵器工業(yè)集團(tuán)北方醫(yī)院深度合作在即，海淀北部醫(yī)學(xué)中心建設(shè)穩(wěn)步推進(jìn)，北醫(yī)三院順義院區(qū)進(jìn)入籌備階段。集團(tuán)化發(fā)展戰(zhàn)略為學(xué)科發(fā)展贏得了寶貴的空間，也為醫(yī)院未來合理布局提供了前所未有的機(jī)遇。

北醫(yī)三院擁有3個(gè)教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)：骨科、運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)研究所、婦產(chǎn)科；3個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：輔助生殖、分子心血管學(xué)（參與）和視覺損傷與修復(fù)（參與）；1個(gè)國家衛(wèi)生健康委重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：心血管分子生物學(xué)與調(diào)節(jié)肽；8個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：磁共振成像設(shè)備與技術(shù)、脊柱疾病研究、生殖內(nèi)分泌與輔助生殖技術(shù)、心血管受體研究、運(yùn)動(dòng)醫(yī)學(xué)關(guān)節(jié)傷病、幽門螺桿菌感染與上胃腸疾病、眼部神經(jīng)損傷重建保護(hù)與康復(fù)、神經(jīng)退行性疾病生物標(biāo)志物研究及轉(zhuǎn)化。

北醫(yī)三院以強(qiáng)烈的社會(huì)責(zé)任感積極投身公立醫(yī)院改革。近年來不斷提高管理水平，參與多個(gè)重大項(xiàng)目和課題的研究，取得成果被政府相關(guān)管理部門所采納。在臨床路徑、優(yōu)質(zhì)服務(wù)護(hù)理工程、對口支援、醫(yī)聯(lián)體建設(shè)、援藏援疆支邊等方面發(fā)揮了醫(yī)院的作用。同時(shí)，醫(yī)院還承擔(dān)著國家重大活動(dòng)的醫(yī)療保障工作，承擔(dān)著重大突發(fā)事件的醫(yī)療救援任務(wù)。近年來，出色完成了北京奧運(yùn)會(huì)、建國六十典、抗震救災(zāi)、健康快車、埃博拉出血熱病人救援、非洲“光明行”、歷次全國“兩會(huì)”等各項(xiàng)醫(yī)療保障任務(wù)。

北京成立多年醫(yī)療公司提供：北京大學(xué)第三醫(yī)院加急檢查掛號，北京大學(xué)第三醫(yī)院加急住院掛號，北京大學(xué)第三醫(yī)院跑腿代辦掛號，服務(wù)每一位患者，幫助您在北京各大醫(yī)院看病少走彎路不浪費(fèi)時(shí)間和金錢。北京兒童醫(yī)院，同仁醫(yī)院 協(xié)和醫(yī)院，天壇醫(yī)院等等各大三甲醫(yī)院均提供掛號，加急加急檢查，快速住院。