在幾代人的共同努力下，北醫(yī)三院已發(fā)展成為國內(nèi)高水平的大型綜合性醫(yī)院，擁有二十個學科為國家臨床重點?？平ㄔO項目（骨科、藥劑科（臨床藥學）、病理科、?？谱o理、檢驗科、消化科、婦科、產(chǎn)科、職業(yè)病科、耳鼻喉科、心血管分子生物學與調(diào)節(jié)肽重點實驗室、呼吸內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科、普通外科、泌尿外科、眼科、麻醉科、康復醫(yī)學科、成形科（整形外科）、運動醫(yī)學科），婦產(chǎn)科為國家婦產(chǎn)疾病臨床醫(yī)學研究中心，產(chǎn)科、康復醫(yī)學科為國家產(chǎn)科專業(yè)、國家康復醫(yī)學醫(yī)療質(zhì)量管理和控制中心。

近年來，醫(yī)院對外合作取得實質(zhì)進展，集團化發(fā)展初具規(guī)模。2018年，受張家口市人民政府和崇禮區(qū)政府委托，接管崇禮區(qū)人民醫(yī)院，北醫(yī)三院崇禮院區(qū)揭牌；受北京大學指派，與延安市政府正式簽約，托管延安市中醫(yī)醫(yī)院，北醫(yī)三院延安分院揭牌；與首都機場集團公司合作，接管北京首都國際機場醫(yī)院，北醫(yī)三院首都國際機場院區(qū)揭牌。此外，兵器工業(yè)集團北方醫(yī)院深度合作在即，海淀北部醫(yī)學中心建設穩(wěn)步推進，北醫(yī)三院順義院區(qū)進入籌備階段。集團化發(fā)展戰(zhàn)略為學科發(fā)展贏得了寶貴的空間，也為醫(yī)院未來合理布局提供了前所未有的機遇。

北醫(yī)三院擁有18個北京市住院醫(yī)師規(guī)范化培訓專業(yè)基地、2個國家衛(wèi)生健康委員會?？漆t(yī)師規(guī)范化培訓基地、2個北京市住院醫(yī)師規(guī)范化培訓技能考核中心。作為北京大學臨床醫(yī)學院，每年有近800名醫(yī)學生、350余名博士生、碩士生在此學習。同時，還承擔著1500余名進修醫(yī)生和近400名北京市住院醫(yī)師規(guī)范化培訓任務。每年110個和北京市級繼續(xù)教育項目吸引了全國各地1.1萬名學員。

醫(yī)院連續(xù)多年榮獲多項榮譽。榮獲全國文明單位、全國衛(wèi)生文化建設先進單位、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進集體、全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)創(chuàng)先爭優(yōu)活動先進集體、全國綜合醫(yī)院中醫(yī)藥工作示范單位、首都十大疾病科技攻關與管理工作核心單位等，神經(jīng)內(nèi)科、心血管內(nèi)科、眼科、運動醫(yī)學研究所、藥劑科等榮獲“全國青年文明號”榮譽稱號，醫(yī)院被中華全國總工會授予“模范職工之家”稱號。 [2]