北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學科作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年牽頭組建北京兒童醫(yī)院集團，創(chuàng)新“病人不動、醫(yī)生移動”的模式服務全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

腫瘤內(nèi)科科室包括兒童實體腫瘤、兒童淋巴瘤兩個專業(yè)，住院部設置在北京兒童醫(yī)院順義院區(qū)，擁有兩個病區(qū)，分別收治兒童實體瘤、淋巴瘤病人。腫瘤內(nèi)科在北京兒童醫(yī)院西城院區(qū)、順義院區(qū)，均設置有專業(yè)門診，均由專業(yè)醫(yī)生團隊出診，患者可根據(jù)需求選擇不同院區(qū)就診。

北京成立多年醫(yī)療公司提供：北京兒童醫(yī)院加急檢查掛號，北京兒童醫(yī)院加急住院掛號，北京兒童醫(yī)院跑腿代辦掛號，服務每一位患者，幫助您在北京各大醫(yī)院看病少走彎路不浪費時間和金錢。北京兒童醫(yī)院，同仁醫(yī)院 協(xié)和醫(yī)院，天壇醫(yī)院等等各大三甲醫(yī)院均提供掛號，加急加急檢查，快速住院。

開展的特色診療項目包括特發(fā)性眼球震顫等復雜斜視的手術(shù)及發(fā)病機制研究，兒童及嬰幼兒角膜移植手術(shù)，兒童眼球震顫及白內(nèi)障術(shù)后個性化視覺功能重建，早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變的綜合診治，Ritleng淚道插管手術(shù)、微創(chuàng)淚道重建術(shù)、鼻內(nèi)窺鏡鼻腔淚囊吻合術(shù)等復雜兒童淚道疾病、利用GORE-TEX新型材料進行額肌懸吊術(shù)兒童上瞼下垂，先天性小瞼裂綜合征微創(chuàng)手術(shù)，視網(wǎng)膜母細胞瘤的個性化綜合， 360°微導管引導下小梁切開術(shù)先天性青光眼等。