2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細(xì)胞移植專業(yè)組，是國內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細(xì)胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細(xì)胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細(xì)胞移植科，同年 6月，干細(xì)胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國北方、保定的兒童造血干細(xì)胞移植中心，現(xiàn)干細(xì)胞移植科分為2個(gè)病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個(gè)病區(qū)共20間百級移植倉，6間千級移植倉，2個(gè)干細(xì)胞采集室，1個(gè)干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室，每年進(jìn)行150-250例造血干細(xì)胞移植，是目前我國北方的兒童造血干細(xì)胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)分別長駐北京和保定同時(shí)開展干細(xì)胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。

科室團(tuán)隊(duì)擁有18名醫(yī)師，1名助理研究員，其中碩士研究生導(dǎo)師1人，副高級以上職稱9人，中級職稱6人。其中博士后1人，具有博士學(xué)位者5人。

團(tuán)隊(duì)成員先后承擔(dān)國家自然科學(xué)基金2項(xiàng)，北京市自然科學(xué)基金2項(xiàng)，教育部博士點(diǎn)基金1項(xiàng)；1人入選北京市人才青年拔尖計(jì)劃(高創(chuàng)計(jì)劃)，1人入選國家外專局培訓(xùn)計(jì)劃，2人入選北京兒童醫(yī)院苗圃計(jì)劃；1人科研成果入選“北京市自然科學(xué)基金十二五期間成果選編”。團(tuán)隊(duì)成員共發(fā)表作者SCI論著多篇，參與編寫書籍多部及指南/專家共識多篇。

科室秉承全心全意服務(wù)于移植患兒的原則，建立移植病人檢查綠色通道，短時(shí)間完成檢查并開始，精益求精，為患兒得到質(zhì)的醫(yī)療服務(wù)和的療效而不斷努力！

北京成立多年醫(yī)療公司提供：北京兒童醫(yī)院加急檢查掛號，北京兒童醫(yī)院加急住院掛號，北京兒童醫(yī)院跑腿代辦掛號，服務(wù)每一位患者，幫助您在北京各大醫(yī)院看病少走彎路不浪費(fèi)時(shí)間和金錢。北京兒童醫(yī)院，同仁醫(yī)院 協(xié)和醫(yī)院，天壇醫(yī)院等等各大三甲醫(yī)院均提供掛號，加急加急檢查，快速住院。

北京兒童醫(yī)院眼科為擁有專業(yè)門診、病房、醫(yī)技檢查、驗(yàn)光配鏡中心、弱視訓(xùn)練、視感知覺工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時(shí)為北京市殘聯(lián)指定殘疾評估、康復(fù)中心，并托管北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院、北京市順義區(qū)婦幼保健院、北京兒童醫(yī)院鄭州醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院新疆醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院黑龍江醫(yī)院。