全宗原則：全宗是一個獨立的機關、組織或個人在社會活動中形成的全部檔案的有機整體。檔案整理要維護全宗的完整性，即同一全宗的檔案不可分散，不同全宗的檔案不得混淆。這有助于保持檔案之間的內在聯(lián)系，反映一個特定主體的活動全貌。比如，某企業(yè)的檔案構成一個全宗，其各個部門、各個時期形成的檔案都應歸屬于這個全宗，不能將該企業(yè)的檔案與其他企業(yè)的檔案混在一起整理。

按來源分類

組織機構分類法：按照檔案形成的組織機構進行分類，將同一部門或單位形成的檔案集中在一起。如政府機關中，不同科室形成的檔案分別歸類，能體現各部門的職能和工作范圍，以及部門之間的協(xié)作關系。

作者分類法：以檔案的作者為分類依據，將同一作者形成的檔案歸為一類。對于個人檔案或一些特定作者群體的檔案，這種分類方法有助于了解作者的思想、工作風格和學術成就等。

按內容主題分類

問題分類法：依據檔案所反映的主題內容進行分類，將同一問題或同一專題的檔案集中整理。例如，企業(yè)關于產品研發(fā)的檔案，可將涉及不同產品研發(fā)的市場調研、技術方案、實驗數據等歸為一類，便于集中查閱和研究相關問題。

事由分類法：按照檔案所涉及的具體事件或事務進行分類。如在處理法律糾紛時，將與該糾紛相關的合同、往來信件、庭審記錄等檔案整理在一起，能呈現事件的起因、經過和結果。

參考相關標準和規(guī)范

國家標準和行業(yè)標準：許多行業(yè)和領域都有關于檔案分類的國家標準或行業(yè)規(guī)范，這些標準提供了通用的分類框架和主題詞表，可以作為確定主題和分類標準的重要參考。例如，《企業(yè)檔案工作規(guī)范》《機關檔案工作條例》等對不同類型檔案的分類都有相應的規(guī)定。

專業(yè)分類體系：對于一些特定的專業(yè)領域，如醫(yī)學、法學、歷史學等，有專門的分類體系和主題詞表。在整理相關專業(yè)檔案時，可以借鑒這些專業(yè)分類體系，使檔案的分類更加科學、準確，便于專業(yè)人員的利用和研究。